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常用蛋白质分析网站

 

从氨基酸组成辨识蛋白质

 

ExPASy：http://www.expasy.ch/tools/

 

PROSEARCH：http://www.embl-heidelberg.de/prs.html

 

预测蛋白质的物理性质：等电点、分子量、酶切特性、疏水性、电荷分布等

 

ExPASy：http://www.expasy.ch/tools/

 

FASTA：ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta/

 

SAPS：http://www.isrec.isb-sib.ch/software/SAPS_form.html

 

跨膜区预测：http://www.isrec.isb-sib.ch/software/tmpred_from.html

 

蛋白质二级结构预测

 

nnPredict：http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict.html

 

PredictProtein：http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/

 

PredictProtein的国内镜像：http://www.cbi.pku.edu.cn/predictprotein/

 

SOPMA：http://pbil.ibcp.fr/

 

二级结构预测：www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict-instrucs.html

 

卷曲螺旋预测

 

COILS：http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html

 

跨膜区段和在膜上的取向预测

 

TMpred：http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

 

信号肽的剪切位点

 

SignalP：http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

 

蛋白质的三维结构

 

SWISS-MODEL：http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html

 

CPHmodels：http://www.cbs.dtu.dk/services/CPHmodels/

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